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9 giugno 2017

Identificazione degli acidi nucleici tramite la tecnologia CRISPR-Cas13a

537_Sherlock

E’ stato creato SHERLOCK o, per esteso, lo Specific High Sensitivity Enzymatic Reporter UnLOCKing, un nuovo dispositivo diagnostico in grado d’identificare concentrazioni attomolari di virus presenti in un semplice campione distinguendo le singole tipologie come lo Zika ed il Dengue. Basato sulla tecnologia CRISPR (Clustered regularly short palindromic repeats e pronunciato crisper), il sistema funziona tramite l’iniziale impiego di un RNA guida (gRNA) per l’inserimento nell’RNA e dal successivo rilascio della RNasi nota come Cas13a o C2c2. Questo enzima riconosce la presenza di una specifica sequenza di RNA programmata con il CRISPR e comincia a tagliare indiscriminatamente qualsiasi RNA non riconosciuto. I ricercatori del gruppo del Prof. Feng Zhang hanno usato questa tecnica su dei campioni contenenti il virus Zika e Dengue con RNA fluorescente; una volta che il Cas13a ha individuato e scisso alcune delle sequenze virali, è stato indotto un rilascio di energia di tipo fluorescente, registrabile dalla strumentazione ed indicativo della presenza del virus. Inoltre, l’apporto di successive modifiche al sistema, ha dimostrato la sua applicabilità non solo all’RNA ma anche al DNA. Da ciò gli autori hanno concluso come la piattaforma SHERLOCK possiede delle caratteristiche superiori alle altre tecnologie per l’identificazione degli acidi nucleici e come la sua “adattabilità” lo rende applicabile anche a numerose, differenti e future applicazioni (es: quantificazione dell’RNA/DNA, identificazione in multiplex dell’espressione dell’RNA o della contaminazione degli acidi nucleici).

Nucleic acid detection with CRISPR-Cas13a/C2c2

Gootenberg J.S., Abudayyeh O.O., Lee J.W. et al.;

Science, Apr 2017, 365, 6336, 438-442

http://science.sciencemag.org/content/356/6336/438