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21 maggio 2018

Nuove scoperte sul ruolo del microbioma intestinale nel carcinoma colon rettale

772_Microbioma

Studi recenti hanno individuato un’associazione tra cancro del colon-retto (CRC) e il microbiota intestinale. Un potenziale meccanismo attraverso il quale il microbiota può influenzare la fisiologia dell’ospite è attraverso l’influenza dell’espressione genica nelle cellule ospiti. Sebbene la variazione della composizione del microbioma intestinale sia stata collegata al cancro del colon-retto (CRC), i fattori che mediano le interazioni tra i tumori CRC e il microbioma sono poco chiari. I microRNA (miRNA) sono un’ampia classe di piccoli RNA non codificanti (21-25 nucleotidi) che regolano l’espressione genica a livello post-trascrizionale, inducendo la degradazione di specifici RNA messaggeri (mRNA), o impedendo la traduzione in proteina. Questi miRNA sono noti per regolare la progressione del CRC e sono associati alla sopravvivenza del paziente. Inoltre, studi recenti hanno suggerito che i miRNA dell’ospite possono anche regolare la crescita batterica e influenzare la composizione del microbioma intestinale. Partendo da questi presupposti, i ricercatori che hanno prodotto questo articolo (guidati dal Prof. Ran Blekhman del Department of Genetics, Cell Biology, and Development, University of Minnesota di Minneapolis, ma che ha avuto come ricercatore principale lo studente del Bioinformatics and Computational Biology Program, University of Minnesota, Rochester, Minnesota, Ce Yuan) hanno studiato l’associazione tra l’espressione di miRNA e la composizione del microbioma nel CRC umano e nei tessuti normali. Hanno così identificato 76 miRNA differenzialmente espressi (DE) nel tessuto da tumori CRC e tessuto normale, compresi i noti miogenici oncogeni miR-182, miR-503 e mir-17 ~ 92 cluster. Questi miRNA DE erano correlati con le abbondanze relative di diversi taxa (unità tassonomiche) batterici, inclusi Firmicutes, Bacteroidetes e Proteobacteria. I batteri correlati ai miRNA DE sono stati arricchiti con distinte categorie metaboliche. Inoltre, gli Autori hanno messo in evidenza che i miRNA correlati ai batteri associati al CRC sono previsti per la regolazione di bersagli che sono rilevanti per le interazioni ospite-microbioma e evidenziano un possibile ruolo nella produzione di glicani basati su miRNA nel reclutamento di taxa microbici patogeni. In sintesi, gli Autori concludono che il loro lavora ha permesso di caratterizzare, nei tessuti di CRC dell’uomo, una relazione globale tra composizione della comunità microbica e l’espressione di miRNA.

Interaction between Host MicroRNAs and the Gut Microbiota in Colorectal Cancer

Ce Yuan, Michael B. Burns, Subbaya Subramanian, Ran Blekhman

mSystems May 2018, 3 (3) e00205-17

http://msystems.asm.org/content/3/3/e00205-17

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