Le informazioni contenute in questo sito sono destinate in via esclusiva agli operatori professionali della sanità in conformità all'art. 21 del D.Lgs. 24 febbraio 1997, n. 46 s.m.i e alle Linee Guida del Ministero della Salute del 17 febbraio 2010 e successivo aggiornamento del 18 marzo 2013. AccettoMaggiori informazioni

4 luglio 2017

Polimorfismi nei singoli nucleotidi potrebbero inficiare i risultati di un saggio PCR

554_DNA tumorale

L’utilizzo di una strumentazione per l’identificazione delle mutazioni nel DNA tumorale circolante nel plasma (ptDNA) deve essere accompagnato da uno studio per il riconoscimento di polimorfismi di conformazione nei singoli nucleotidi (SNP) associati al locus genetico di riferimento. I saggi diagnostici basati su analisi molecolari sono particolarmente utili nell’identificazione delle differenti tipologie di carcinoma; per questa ragione Eric S. Christenson e colleghi si erano serviti di una piattaforma PCR (reazione a catena della polimerasi) per determinare le mutazioni K700E della subunità SF3B1 nei campioni clinici di pazienti affetti da carcinoma e con relative mutazioni nel ptDNA. Sebbene la maggior parte dei campioni avesse dimostrato la comune mutazione della SF3B1, la mutazione K700E aveva rivelato di essere prossima al 100% nel caso di uno specifico paziente. Un approfondimento di questo caso specifico ha mostrato come quest’unico paziente aveva un SPN (R702R) che comportava una impossibilità da parte del saggio PCR di riconoscere l’allele analogo. I ricercatori hanno quindi concluso evidenziando l’importanza d’identificare con accuratezza i potenziali SPN presenti nei loci sottoposti ad analisi, in modo che non interferiscano con l’efficacia dei saggi PCR durante le fasi di diagnosi e nel monitoraggio di pazienti affetti da carcinoma.

Single-Nucleotide Polymorphism Leading to False Allelic Fraction by Droplet Digital PCR

Christenson E.S., Dalton W.B., Chu D. et al.

Clinical Chemistry, Jun 2017

http://clinchem.aaccjnls.org/content/early/2017/06/12/clinchem.2017.273177